O记干探许浚森（陈展鹏 饰）、沈韦力（黄智贤 饰）奉命调查跨国罪案期间，得悉“杀虎案”幕后黑手魏子乐（张颖康 饰）落网前，曾将神秘信息发送至暗网，并导出巨额加密货币。不久有神秘人策动恐袭，浚森与韦力纵于天才教授唐冠峰（方力申 饰）协助下破案，却惊觉子乐背后藏着更大阴谋！他们要竭力阻止子乐的同时，也遇到龙头棍风暴、空屋藏白骨、重犯越狱等奇案，能否一一扫除险阻？工作上面对的危机升级，感情亦遇挑战，浚森望跟前女友马颖思（林夏薇 饰）复合，但困难重重令二人关系出现变数……

前两部《魔法少女小圆》之剧场作品为12集电视版本之总集篇，其中计划包括重新剪辑的电视版内容和配乐，并会追加全新作画。前篇命名为“开始的故事”（始まりの物語），于2012年10月6日上映；后篇命名为“永远的故事”（永遠の物語），于一周后的2012年10月13日上映。